L'orgue
Dès le début du XVIe siècle, il y a eu des références aux orgues et aux facteurs d'orgue dans les comptes de la Noble Confrérie. Les archives mentionnent plusieurs facteurs d'orgues qui ont effectué des réparations ou installé un nouvel orgue aux XVIe, XVIIe et XVIIIe siècles.
Les noms importants sont Lauwereyns Veldam, Jan Waghers (XVIe siècle), Crespin du Bois, Boudewijn Ledou (XVIIe siècle).
En 1751, Isabelle Claesman, fille du baron van Male, fit don d'un nouvel orgue fabriqué par le célèbre facteur d'orgues brugeois Andries Jacob Berger (1712 - 1774). Cet instrument précieux a été détruit ou disparu pendant la Révolution française.
Le facteur d'orgues brugeois Hooghuys fabrique un nouvel orgue en 1836. Il est placé sur un nouvelle tribune de la façade ouest. Cependant, ce tribune a dû disparaître pour l'installation d'un nouveau vitrail. La tribune avec orgue a été démoli en 1854 et vendu au curé Slock de Roulers. L'orgue romantique tardif date de 1912 et a été conçu par le facteur d'orgue Jules Anneessens de Menin.
Organiste Eric Hallein
Eric Hallein est organiste de la Basilique du Saint-Sang depuis septembre 2012. Il est également directeur artistique de l'Orgelkring Adriaen Willaert, qui organise des concerts dans la région de Bruges, voir: www.organassociation-adriaenwillaert.com. En plus de son Master en orgue de spécialisation Musique, il a également obtenu les diplômes supérieurs de clavecin et de musique de chambre. Il a étudié au Conservatoire Royal de Bruxelles et au Conservatoire de Maastricht.
En 1981, Eric Hallein est devenu lauréat de la Fondation Horlait-Dapsens. En tant qu'organiste de concert, il s'est produit dans la plupart des pays d'Europe ainsi qu'en Afrique du Sud, aux États-Unis et au Vietnam. Il a réalisé plusieurs enregistrements pour la radio belge, la radio espagnole et la télévision polonaise. Il a également réalisé les CD: "Musique d'orgue symphonique de Flandre", "Flor Peeters Organworks" et "Sons d'orgue du Conservatoire de Bruxelles" avec des musiques de Lemmens, Widor, Tinel et Jongen.
De 1981 à 1996, Eric Hallein a enseigné l'harmonie pratique au Conservatoire Royal de Bruxelles et aussi pendant une courte période au Conservatoire Royal de Gand. Il a également été professeur de musique aux Académies d'Ypres, de Menin et de Roulers, où il était également accompagnateur de clavecin et de piano.